PubChemデータベースは、独自のフィンガープリントを構築して Webサイト内での類似度検索に使っています。そのフィンガープリントの構成は既に公開されているのですが、 881ビットもあるので、ちまちま実装するのは面倒です。 そこでCDKを見てみると… Pubche…

Molprint 2Dは、Benderら*1によって開発・実装されたフィンガープリントで、 研究目的であればフリーで使えます。 http://www.molprint.com/ 今日は、旨味成分のグルタミン酸[ OC(=O)CCC(N)C(=O)O ]から計算してみましょう。 入力ファイルは、MOL2形式限定で…

指紋を認識するアルゴリズムでは、線（隆線）の切れ目や分岐点の座標情報を抽出して 登録/照合を行うタイプが主流だそうです。 これら特徴点の数や位置は人によって異なりますので、個人認証にぴったりというわけです。 化合物にも、フィンガープリント（fin…