chemical beauty (2)
(1) のつづき。
Bickertonら*1は、QEDを定義したあと、薬物候補を判別するベンチマークを行いました。
従来から使われているリピンスキーの法則より優れていることを示すためです。
- 正例：DrugBank登録の薬物
- 負例：PDB登録の低分子リガンド
ここで「QEDの方が高い分離能を示しました。」だけで締めくくらないのが、
この論文のチャームポイントです。
さて、製薬化学者は、化学構造を目で見て、直感的にその良し悪しを判断できます。
これはコンピュータでは対応が困難であり、一種の職人芸と言って良いと思います。
Bickertonらは、これを「Chemical aesthetics」と呼び、
製薬化学者の判断とQEDの出力との関連性をさらに調べました。
すると、
という結果を得たそうです。こういう評価を丁寧に行うことも大切ですよね。
