「薬らしさ（drug-likeness）」という指標があります。 これは、物性が承認薬と似ているという基準で候補化合物をざくっと絞り込むときに使います。 有名な指標は、リピンスキーの法則ですが、最近、新たな指標が提案されたので取り上げます。 それは、Bicke…

前回の続き。 こんどは、構造の一部のみを"回転"させます。 OpenbabelのRotateメソッドを使ってみます。 回転可能な結合を適当に見つけてきて、 二面角をなす4原子の番号を関数に入力します。 （この番号は、SDFにおける登場順で付けられます） #include <stdio.h> #i</stdio.h>…

あけましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いいたします。今年こそは、新しいことに挑戦しようと思います。 さて、化合物の動画について、まとめてみます。 まずは、単純な平行移動から。 Openbabel（ver2.3.0）を使います。Translateメソッドで…