ファーマコフォア (pharmacophore)とは、分子構造の抽象的な特徴を３次元空間上に配置したものです。 たとえば、２つの窒素原子と１つの酸素原子が以下のように配置した ファーマコフォアを定義してみます。 CDKのPharmacophoreMatcherクラスを使って、この…