OpenBabel

化合物が流れる動画 (3)

前回の続き。 こんどは、構造の一部のみを"回転"させます。 OpenbabelのRotateメソッドを使ってみます。 回転可能な結合を適当に見つけてきて、 二面角をなす4原子の番号を関数に入力します。 (この番号は、SDFにおける登場順で付けられます) #include <stdio.h> #i</stdio.h>…

化合物が流れる動画 (2)

あけましておめでとうございます。 本年もよろしくお願いいたします。今年こそは、新しいことに挑戦しようと思います。 さて、化合物の動画について、まとめてみます。 まずは、単純な平行移動から。 Openbabel(ver2.3.0)を使います。Translateメソッドで…