2011-10-16から1日間の記事一覧

部分構造検索 (2)

OpenBabelに「obgrep」という部分構造検索コマンドがあるのですが、 CDKのUniversalIsomorphismTesterクラスとどちらが優れているか検証してみようという企画です。【比較条件】 QueryはSMILES形式の環構造。 検索対象DBは、DrugBankの6620化合物(SDF形式)…