化学構造情報には、定型のファイル形式があり、 さまざまなソフトウェアで互換できるように設計されています。 代表的なものに、 SMILES (すまいるず) SMARTS (すまーつ) SMIRKS (すまーくす) InChI （いんち） SDF (えすでぃーえふ) MOL (もる) MOL2 (もる…